Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SNTG1Q9NSN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTG1Q9NSN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTG1Q9NSN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG1Q9NSN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 628.4 ms