Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS25

SPANXB1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXB1Q9NS25 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXB1Q9NS25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPANXB1Q9NS25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXB1Q9NS25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXB1Q9NS25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXB1Q9NS25 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms