Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS4Q9NQG7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS4Q9NQG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS4Q9NQG7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS4Q9NQG7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPS4Q9NQG7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS4Q9NQG7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS4Q9NQG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS4Q9NQG7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms