Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD2Q9HC29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOD2Q9HC29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD2Q9HC29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD2Q9HC29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD2Q9HC29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms