Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLRE1BQ9H816 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLRE1BQ9H816 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLRE1BQ9H816 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLRE1BQ9H816 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms