Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7X7

IFT22, Intraflagellar transport protein 22 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT22Q9H7X7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT22Q9H7X7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT22Q9H7X7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT22Q9H7X7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT22Q9H7X7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFT22Q9H7X7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT22Q9H7X7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms