Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SUDS3Q9H7L9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUDS3Q9H7L9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUDS3Q9H7L9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SUDS3Q9H7L9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms