Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C12orf49Q9H741 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf49Q9H741 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf49Q9H741 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf49Q9H741 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf49Q9H741 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf49Q9H741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms