Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPA3Q9H6K4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPA3Q9H6K4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPA3Q9H6K4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPA3Q9H6K4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms