Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNMDQ9H2S6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNMDQ9H2S6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNMDQ9H2S6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNMDQ9H2S6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNMDQ9H2S6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms