Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1EQ9GZS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1EQ9GZS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1EQ9GZS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms