Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO4Q9GZR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REXO4Q9GZR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REXO4Q9GZR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REXO4Q9GZR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms