Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE2OQ9C0C9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2OQ9C0C9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
UBE2OQ9C0C9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2OQ9C0C9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2OQ9C0C9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2OQ9C0C9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2OQ9C0C9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2OQ9C0C9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms