Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARHL1Q9BZE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BARHL1Q9BZE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARHL1Q9BZE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARHL1Q9BZE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms