Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD2Q9BYW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD2Q9BYW2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SETD2Q9BYW2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD2Q9BYW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD2Q9BYW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SETD2Q9BYW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SETD2Q9BYW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.4 ms