Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms