Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUSAP1Q9BXS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUSAP1Q9BXS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUSAP1Q9BXS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUSAP1Q9BXS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUSAP1Q9BXS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUSAP1Q9BXS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUSAP1Q9BXS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms