Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD7Q9BUK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD7Q9BUK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD7Q9BUK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD7Q9BUK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms