Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RBM42Q9BTD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RBM42Q9BTD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RBM42Q9BTD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RBM42Q9BTD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RBM42Q9BTD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RBM42Q9BTD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms