Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPGQ9BPX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPGQ9BPX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPGQ9BPX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPGQ9BPX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAPGQ9BPX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms