Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD5Q99717 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD5Q99717 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD5Q99717 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD5Q99717 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD5Q99717 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms