Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SCAF11Q99590 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAF11Q99590 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SCAF11Q99590 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAF11Q99590 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF11Q99590 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAF11Q99590 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SCAF11Q99590 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SCAF11Q99590 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms