Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGMNQ99538 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGMNQ99538 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LGMNQ99538 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LGMNQ99538 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LGMNQ99538 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms