Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
YME1L1Q96TA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YME1L1Q96TA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YME1L1Q96TA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YME1L1Q96TA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
YME1L1Q96TA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YME1L1Q96TA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YME1L1Q96TA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms