Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRPK1Q96SB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPK1Q96SB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRPK1Q96SB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRPK1Q96SB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRPK1Q96SB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms