Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP4Q96P64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP4Q96P64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP4Q96P64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms