Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LOXL4Q96JB6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LOXL4Q96JB6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LOXL4Q96JB6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LOXL4Q96JB6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LOXL4Q96JB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LOXL4Q96JB6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms