Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCMH1Q96GD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCMH1Q96GD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCMH1Q96GD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCMH1Q96GD3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms