Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNFT2Q96EX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNFT2Q96EX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNFT2Q96EX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNFT2Q96EX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNFT2Q96EX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms