Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP40Q96DI7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP40Q96DI7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP40Q96DI7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP40Q96DI7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP40Q96DI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms