Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF428Q96B54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF428Q96B54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF428Q96B54 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF428Q96B54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF428Q96B54 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF428Q96B54 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms