Protein–RNA interactions for Protein: Q96A46

SLC25A28, Mitoferrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28Q96A46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A28Q96A46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A28Q96A46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A28Q96A46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A28Q96A46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A28Q96A46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A28Q96A46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A28Q96A46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A28Q96A46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms