Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCC1Q92922 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCC1Q92922 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCC1Q92922 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCC1Q92922 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCC1Q92922 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCC1Q92922 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCC1Q92922 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCC1Q92922 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCC1Q92922 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCC1Q92922 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCC1Q92922 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCC1Q92922 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms