Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL3LQ92901 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3LQ92901 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL3LQ92901 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL3LQ92901 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL3LQ92901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms