Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDAQ92838 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDAQ92838 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDAQ92838 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDAQ92838 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EDAQ92838 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDAQ92838 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDAQ92838 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDAQ92838 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDAQ92838 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDAQ92838 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDAQ92838 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDAQ92838 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDAQ92838 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDAQ92838 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EDAQ92838 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDAQ92838 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDAQ92838 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDAQ92838 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDAQ92838 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDAQ92838 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDAQ92838 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDAQ92838 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDAQ92838 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDAQ92838 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDAQ92838 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDAQ92838 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDAQ92838 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDAQ92838 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDAQ92838 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDAQ92838 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDAQ92838 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDAQ92838 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDAQ92838 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDAQ92838 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDAQ92838 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDAQ92838 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDAQ92838 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDAQ92838 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDAQ92838 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDAQ92838 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDAQ92838 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDAQ92838 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EDAQ92838 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDAQ92838 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDAQ92838 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDAQ92838 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDAQ92838 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDAQ92838 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDAQ92838 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDAQ92838 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDAQ92838 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDAQ92838 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDAQ92838 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDAQ92838 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDAQ92838 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDAQ92838 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EDAQ92838 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDAQ92838 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDAQ92838 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDAQ92838 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDAQ92838 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDAQ92838 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EDAQ92838 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EDAQ92838 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EDAQ92838 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDAQ92838 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDAQ92838 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EDAQ92838 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDAQ92838 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDAQ92838 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDAQ92838 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDAQ92838 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDAQ92838 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDAQ92838 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDAQ92838 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDAQ92838 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDAQ92838 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDAQ92838 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDAQ92838 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDAQ92838 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDAQ92838 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDAQ92838 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDAQ92838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDAQ92838 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDAQ92838 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDAQ92838 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDAQ92838 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDAQ92838 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDAQ92838 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDAQ92838 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDAQ92838 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDAQ92838 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDAQ92838 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDAQ92838 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDAQ92838 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDAQ92838 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDAQ92838 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDAQ92838 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDAQ92838 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms