Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA1Q92743 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTRA1Q92743 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA1Q92743 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA1Q92743 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms