Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCSTNQ92542 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCSTNQ92542 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCSTNQ92542 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCSTNQ92542 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCSTNQ92542 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms