Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM3CQ92520 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM3CQ92520 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM3CQ92520 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM3CQ92520 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM3CQ92520 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM3CQ92520 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms