Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf40Q8WUR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf40Q8WUR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf40Q8WUR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf40Q8WUR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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