Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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