Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF128Q8TEB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF128Q8TEB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF128Q8TEB7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF128Q8TEB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF128Q8TEB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF128Q8TEB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF128Q8TEB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF128Q8TEB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF128Q8TEB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF128Q8TEB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF128Q8TEB7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF128Q8TEB7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF128Q8TEB7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms