Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PMFBP1Q8TBY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PMFBP1Q8TBY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PMFBP1Q8TBY8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PMFBP1Q8TBY8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PMFBP1Q8TBY8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PMFBP1Q8TBY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PMFBP1Q8TBY8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PMFBP1Q8TBY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PMFBP1Q8TBY8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PMFBP1Q8TBY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PMFBP1Q8TBY8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms