Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C3orf20Q8ND61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C3orf20Q8ND61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C3orf20Q8ND61 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3orf20Q8ND61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C3orf20Q8ND61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C3orf20Q8ND61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms