Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms