Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC63Q8NA47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC63Q8NA47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC63Q8NA47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC63Q8NA47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms