Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER3Q8N944 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMER3Q8N944 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AMER3Q8N944 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMER3Q8N944 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms