Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNKDQ8N490 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNKDQ8N490 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNKDQ8N490 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms