Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
LTBP4Q8N2S1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LTBP4Q8N2S1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LTBP4Q8N2S1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LTBP4Q8N2S1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LTBP4Q8N2S1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LTBP4Q8N2S1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
LTBP4Q8N2S1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LTBP4Q8N2S1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LTBP4Q8N2S1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LTBP4Q8N2S1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LTBP4Q8N2S1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LTBP4Q8N2S1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.2 ms