Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
VWDEQ8N2E2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
VWDEQ8N2E2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
VWDEQ8N2E2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
VWDEQ8N2E2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
VWDEQ8N2E2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
VWDEQ8N2E2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
VWDEQ8N2E2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
VWDEQ8N2E2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms