Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD302Q8IX05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD302Q8IX05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD302Q8IX05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD302Q8IX05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD302Q8IX05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms